Свойства аминов определяются строением функциональных групп -NH₂, (-NHR или -NR₃), характером химических связей, природой углеводородных радикалов и взаимным влиянием атомов.
Атом азота в молекулах алифатических аминов, как и аммиака, находится в состоянии sp³-гибридизации. В образовании его связей с атомами водорода или углерода участвуют три гибридные sp³-орбитали, валентные углы между которыми близки к тетраэдрическим (около 109°). Четвертая sp³-орбиталь азота занята неподеленной парой электронов.
При этом атом азота может выступать донором пары электронов, образуя новую (четвертую) связь по донорно-акцепторному механизму.

В аминах имеются связи С–H и С–C (их характеристика уже дана в части II), а также связи N–H и N–C.
Связи азота с углеродом или водородом — полярные ковалентные. Это следует из значений электроотрицательностей азота (3,0), водорода (2,1) и углерода (2,5). При этом связи N–C и N–H существенно менее полярны, чем аналогичные связи кислорода (С–О и O–H), электроотрицательность которого выше (3,5).
Разрыв полярных связей, как известно, происходит преимущественно гетеролитически. Следовательно, для реакций с участием этих связей характерен ионный механизм.
Атом азота в аминах, также как в аммиаке, имеет неподелённую электронную пару, которая может участвовать в образовании ковалентой связи по донорно-акцепторному механизму с электронодефицитным реагентом.